[QIIME2] 설치하기(Illegal instruction 해결)
QIIME is caching your current deployment for improved performance. This may take a few moments and should only happen once per deployment. Illegal instruction (core dumped)
현재 QIIME2는 2023.9 VER 까지 나왔는데 Illegal instruction 에러가 떠서 검색해보니 아마 가상머신의 우분투와 버전 호환이 안되어서 그럴 확률이 높다는 스레드를 보았다.
그래서 나는 2020.11 VER 으로 다운로드를 받았고 이 에러를 고칠 수 있었다.
먼저 설치 환경은 다들 미니콘다를 추천하길래 미니콘다를 설치하였다.
https://makepluscode.tistory.com/196
Ubuntu 20.04 미니콘다 설치
아나콘다의 가벼운 버전, minicoda 미니콘다 설치 아나콘다는 Python 개발환경을 쉽게 구축해주는 도구 이다. 아나콘다는 Python 개발환경과 많은 패키지를 포함하기 때문에 설치 용량이 크다. 좀 가
makepluscode.tistory.com
다 설치하고 나서
export PATH=~/miniconda3/bin:$PATH # conda not found 일때이 코드를 실행해주는 것이 좋다.
그리고 본격적으로 QIIME2 설치에 들어간다.
https://bioinfoblog.tistory.com/8
[QIIME] 마이크로바이옴 데이터 분석을 위한 QIIME 2 설치
QIIME 2는 next-generation sequencing으로 분석된 마이크로바이옴 데이터에 대한 분석을 제공하는 종합 플랫폼이다. 굉장히 유용한 기능을 갖추고 있는데, 이번 포스트에서 그 설치방법을 정리해보려고
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이 티스토리 글을 참고하였다.
그리고 잘 실행되는지 확인하기 위해 튜토리얼을 진행하였다.
https://bio-kcs.tistory.com/entry/QIIME2-tutorial-%E2%80%9CMoving-Pictures%E2%80%9D-1
[QIIME2 튜토리얼] “Moving Pictures” (1)
0. 분석 데이터 관찰하기 사람의 마이크로바이옴 데이터로 항생제 사용에 관하여 몸에 4개의 부위(장, 혀, 양 손바닥(에서 5개의 샘플을 채취하여 관찰한 것이다 (논문 : Caporaso et al. (2011) ) 이는 Ea
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어찌저찌 성공하기는 했다.
QIIME 2 View
( downloading site resources )
view.qiime2.org
근데 아직 기본적인 용어들도 몰라서 공부해야한다.
설치하는데 이유없는 에러로 너무 고생했지만 드디어 해냈다.