contig1 [Genome assembly] contig 또는 consunsus 만들기 용어 정의Contigde novo assembly로 만들어진 연속된 시퀀스 조각Consensusreference genome + 변이 정보(VCF)를 조합해서 만든 대표 유전체 서열 Contig생성 방식de novo assembly (reference 없이 직접 조립)입력FASTQ툴 예시SPAdes, Velvet, Unicycler글쓴이는 SPAdes를 이용해서 assembly를 진행함. (python 3.10 환경이 안정적이라고 함.)spades.py -1 /home/hkim/share/ex_1.fq.gz -2 /home/hkim/share/ex_2.fq.gz -o /home/hkim/share/spades_output --isolate Consensus생성 방식reference-guided (refe.. 2025. 7. 3. 이전 1 다음